Margarin, sağlığımız üzerinde olumsuz etkileri olabilecek bileşenler barındırdığı için Dünya Sağlık Örgütü tarafından önerilmemektedir. Trans yağlar ve çeşitli katkı maddeleri içeren bu ürünlerin, özellikle kalp hastalıkları ve diğer sağlık problemleri ile ilişkili olduğu belirtilmektedir. Bunun yerine, doğal bitkisel yağların tüketimi teşvik edilmektedir.
Dünya Sağlık Örgütü (DSÖ), margarinlerin tüketilmemesi gerektiğini belirtmektedir.
Margarin, trans yağlar, potasyum sorbat, soya yağı ve gıda boyaları içermektedir. Bu bileşenler, margarin tüketiminin kalp hastalıkları başta olmak üzere birçok sağlık sorununa yol açmasına neden olmaktadır.
DSÖ, margarin yerine mümkün olduğunca doğal bitkisel yağların kullanılmasını önermektedir.